O filtro biológico é um conceito importantíssimo para o aquarismo. E também para a oceanografia, mas leva outro nome: alça microbiana. A matéria orgânica dissolvida produzida pelos organismos é consumida por bactérias heterotróficas. No entanto, no oceano, outros organismos consumirão essas bactérias, reintroduzindo o carbono na teia alimentar.